回到营地，众人将虫王关进铁笼里，看热闹的士兵围满了笼子，谁都想看看虫王究竟长成什么样，毕竟这些可怕的异虫杀伤力给军团的士兵留下了深刻的印象。被囚禁的虫王，不仅可以生育其他异虫，而且具有高级智慧，是虫族的首脑，可以用心灵电波和同类交流，指挥他们协同作战。
为了防止虫王召唤异虫飞到营地，教授特意用铅皮将铁笼封了起来，断绝了虫王发出的信息。同时军团成立一个科研小组，由董教授带队，日以继夜的对虫王展开研究，终于研制出了应对变种人枯萎症的药品。
至此，变种人类终于摆脱了对旧世界生命场的依赖，能够在这个新世界长久的生存繁衍下去。异虫仍然在不断繁衍自己的种群，不断蚕食着红芒区母体的领地，红芒区越来越小，照这样的势头下去，红芒区很快就要从地球上消失。但异星没有坐以待毙，红芒区的母体不断生产进化出如蝙蝠一般的食虫兽，专门吞噬红芒区入侵的异虫，正所谓道高一尺魔高一丈，双方都在不断进化，不断将彼此吞噬，此消彼长，渐渐地虫族和红芒区的异形达到一种动态的平衡，虫族既没有完全消灭红芒区的异形，母体的藤蔓也无法扩张，只能死守在自己固有的领域中。
地球上那些幸存的人类终于有了喘息的时间，腾出手来修复和发展各自的文明和科技，胜光军团不断扩大地盘，入伍的人越来越多，军团在废墟中建立起了自己的军事基地，各种工厂拔地而出，生产着各种物资和军火，胜光军团在铁腿将军的领导下发展的如火如荼。
由于易天集团高层遭到重创，研究进展一度停滞了下来。联合国重新组织了一批年轻的科学家进入公司，继续易天集团未完成的智能研究事业，不得不说人类学习和创新的天赋无与伦比，不久之后，这些年轻的科学家就掌握了大量的科技和经验，在李开灵的带领下又让易天集团步入了正轨。
东盟邀请了各地的科学家到他们发现的地下古城考察和研究，进一步发掘出不少的古代科学技术，除了人工智能方面的技术，古代核动力系统已经被人类完全掌握，各种车辆船舶再也不需要石油提炼出来的油料了，都使用上了核电池，不会再冒出黑乎乎的油烟污染环境。
红芒世界的异星已经和这个星球完全融合同化了，再也无法区分彼此，由此产生了一个新的世界，也产生了众多新的物种。没有了异星的控制影响，女妖韩琳儿完全恢复了自由，不再是异星的傀儡，作为红芒区最大的母体霸主，女妖控制着众多的母体，进一步收缩红芒区的范围，领导它们对抗虫群的侵蚀和人类的反抗。
世界风云不断变换，新的威胁无处不在，幸存的人们期待文明和秩序的重建。联合国为此召开了没完没了的会议，越来越庞大的虫群不断侵蚀红芒区，同样对人类社区造成了巨大的威胁，已经有好几处人类的定居点遭到了虫潮的袭击，损失惨重。于是各地的研究基地又在开展研究对付虫群的武器。神秘的改造人领袖皇世恩成立了自己的机器人王国，依托母船和其中的灵媒帮助，带领着数量众多的改造人在北极地区不断吞并土地，建立一个又一个机器人城镇，成为一个不可小觑的武装势力。
变种人和新出现的机器改造人矛盾在不断加深，冲突时有发生。为了调和两者之间的矛盾，联合国邀请了改造人的首领皇世恩，希望他能够和变种人握手言和，一同谋求未来人类的发展。
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